后因《关于法国音乐的信》被取消了免费进入歌剧院的权利。
1754年 卢梭42岁
和果佛古尔、瓦瑟结伴前去日内瓦，发现了果佛古尔的恶行。受到日内瓦各界人士的热烈欢迎，恢复了其在日内瓦的公民权，重皈新教。
探望华伦夫人，并为华伦夫人的衰老和贫困而伤感。
开始起草《政治制度论》。后来选取其中一部分出版为《社会契约论》。《社会契约论》是卢梭阐发政治思想的经典之作，论述的是他自己的政治理想，在他看来一个合理的政治状态应当是人与人之间结成社会契约。在这个契约中，每个人都通过放弃自己天然的自由，来实现契约的自由。全体人民的意志集合成了一个公意，而主权者代表这个公意进行立法，之后人民选出执政官按照法律来管理社会。卢梭认为一切权力属于人民，人民有权利选举执政官，参与一切公共事务。政府的一切行为都要为了人民的利益而进行。
由于厌恶了频繁的社交生活，常常到树林里散步。
1755年，孟德斯鸠去世。葡萄牙里斯本大地震，导致三万人死亡。
1756年 卢梭44岁
和瓦瑟迁往退隐庐。退隐庐原是埃皮奈夫人的房产，卢梭在退隐庐期间得到埃皮奈夫人的资助。在退隐庐生活将近两年，尽管无法完全避免交际，但卢梭还是很享受这种孤独宁静的乡村生活的。
1756至1763年发生“七年战争”。交战双方是由欧洲主要国家组成的两大集团：一方为普鲁士、英国，另一方为法国、奥地利、萨克森、瑞典、俄国等国。双方为争夺殖民地和海域在欧洲、非洲和印度等地发生大规模的战争，最终以英国和普鲁士的胜利而告终。
1757年 卢梭45岁
与乌德托夫人恋爱，因此和狄德罗、格里姆、埃皮奈夫人闹翻。创作《新爱洛绮丝》，并沉浸在对故事情节的幻想之中。这部书信体小说表达了卢梭对爱情的理想，作品中的朱丽是卢梭理想的爱情对象，他通过家庭教师圣·普乐和贵族小姐朱丽的不幸爱情故事，热情歌颂了自然感情的伟大，批判了封建婚姻的荒谬和违反人性。
开始准备创作《爱弥儿》。
于年底搬出退隐庐，迁至蒙莫朗西居住。在《爱弥儿》一书出版之前，卢梭在蒙莫朗西一直受到卢森堡夫妇的庇护和资助。虽然《爱弥儿》是一部伟大的教育著作，但也是给卢梭带来沉重灾难的一部著作。卢梭没有亲自教育过自己的任何一个子女，却仅是通过想象写出一部教育名著，在书中以极大的热情来培养“爱弥儿”。卢梭主张，从教育儿童开始改变人与人之间的奴役和不平等现象，培养自然发展的健康的下一代。他提出自然教育，主张让人服从自然的法则，使人的身心得到自由发展，通过生活和实践，让儿童在具体的环境中体验生活，从而获得必要的知识。他认为自然教育的目的就在于使儿童获得自由、平等、博爱的思想，培养儿童的劳动技能。
1761年 卢梭49岁
《新爱洛绮丝》出版，此书受到女性读者的热捧。
卢森堡元帅去世。
1762年 卢梭50岁
由于出版《爱弥儿》，法国法院对卢梭发出了逮捕令，查禁了他的书。
其实在《爱弥儿》出版之前的一段时间内，卢梭已经渐渐感到气氛不对，但是他认为自己是正直无辜的，因此并不感到慌张。
《社会契约论》《爱弥儿》出版。
巴黎大主教毕蒙对《爱弥儿》发出禁令，不久之后，巴黎高等法院也发出禁令，并且下令逮捕卢梭。在之后长达8年的时间里，卢梭一直都在逃难。他不得不在各种谴责、迫害甚至是密探的监视下生活，这让他变得敏感多疑，以致后来不断地怀疑身边的人要谋害他。
卢梭从巴黎只身逃至日内瓦，然而日内瓦当局却焚烧《爱弥儿》和《社会契约论》，并下令追捕作者。
逃到伯尔尼，再次受到驱逐。
华伦夫人去世。
1763年 卢梭51岁
卢梭逃至普鲁士辖内的纳沙泰尔，和瓦瑟一起居住在莫蒂埃。结识了乔治·吉斯元帅。
接受了普鲁士国王的庇护，但还是拒绝接受国王的馈赠。获得纳沙泰尔公民权，放弃了日内瓦公民权。
出版《致毕蒙教皇书》，抗议教会当局对他的迫害。
1764年 卢梭52岁
出版《山中书简》，以责问日内瓦当局的不当行为。
德·布达福柯——科西嘉解放运动领袖，邀请卢梭为科西嘉起草宪法。1765年 卢梭53岁
《科西嘉宪法草案》出版。谢绝了普鲁士国王授予的年金。
迁居至伯尔尼的圣皮埃尔岛，瓦瑟搬来和他一起居住。在享受了几个月宁静的隐居生活后，卢梭再次遭到驱逐。
在巴黎，伏尔泰的《哲学辞典》和卢梭的《山中书简》一起被焚烧。卢梭独自潜回