随着天津、北平、上海相继沧沦，国防最高会议决定国民政府迁移重庆，11月20日，发表迁都宣言。蒋介石及国民政府重心机构并没有马上入川，而是迁移到武汉。他还有顾虑：一是以韩复榘、宋哲元为首的一批北方将领能否利用黄河天险，在中原组织有效的抵抗，确保后方及华中侧翼的安全问题。二就是以刘湘为首的一批川军将领能不能保证中央机关安全入川。
蒋介石的担心并非空穴来风，据宋哲元的密报，韩复榘曾派人游说宋部，提出由刘湘令川军封闭入川之路，韩本人率部撤居南阳、襄樊、汉中一带，劝宋部撤守潼关以西，然后联名通电倒蒋。蒋介石吓出了一身冷汗。刘湘、韩复榘、宋哲元三部有数十万大军，在外有日军步步紧逼的形势下，如果联合行动，真的是能“把天打一个洞”的。
对刘湘积极支持抗战的表现，蒋介石是十分赞赏的，但刘对韩复榘的暧昧态度不得不使蒋介石有所顾虑。在获悉韩复榘的阴谋之后，蒋介石不动声色。随战势变化，他任命刘湘为第七战区司令长官。刘湘无法抗拒，为了怕被蒋介石化瓦解，带病亲自率领主力部队到南京前线。大量川军外调为中央政府各部门顺利迁移重庆铺平了道路。后来，韩复榘战场上擅自撤退，蒋虽以临阵脱逃罪将韩处决，并没有公布其拥川独立的阴谋，更未以汉奸罪披露。
为此，蒋介石付出了一定代价，因蒋韩间积怨较深，处死韩曾引起世人对蒋介石“公报私仇”的猜疑和议论。如果披露韩复榘的分裂阴谋，这种议论便会烟消云散，但蒋介石宁可承受舆论不明真相的压力，也未披露韩、刘阴谋真相，其目的在于继续团结川军和韩复榘旧部及宋哲元部抗日。
1938年1月20。日，刘湘在汉口病死，国民政府为刘举行了隆重的“国葬”，以安抚川军，这对其他杂牌军也有稳定作用。蒋介石的这一宽容态度和处置办法，有利于巩固抗日阵线。但是，接着采取的一系列措施却显得操之过急，也有损人心。
刘湘死后，四川已是群龙无首，蒋介石认为控制四川的机会到了。刘湘死后三天，蒋介石连下几道命令，撤销刘湘第七战区司令长官、川康绥靖主任和四川省主席等职务，同时任命张群为四川省主席，撤销川康绥靖公署。此举遭到川康实力派的强烈反对，率军留守四川的17名旅长联名致电蒋介石，反对张群主川。刘的部下认为：刘湘刚死，蒋介石既不派员来蓉慰言，又不与有关各方商洽，即命张群主川，实属“趁火动劫，意图宰割”。因而群情激昂，决定反对张群来川，在成都全城张贴标语，并举行游行示威。
成都的激烈反应使蒋介石大为震惊，也使他清楚地意识到川事非常棘手。蒋介石考虑到四川已成为抗战的大后方，若是动荡不发，国民政府就无法在四川立足，而当时的形势不允许他对川用兵。蒋介石于是改变策略，复电安抚四川各将领，同时，一面保留川康绥靖公署，任命钟体乾为主任，另一方面则任命张群为重庆行营主任，并拟委派曾任重庆行营主任的顾祝同代替张群主持川政。代理全川保安司令王陵基得消息后，声称“顾祝同如敢飞成都，当以大炮在机场欢迎”。蒋介石无奈，只好满足四川军阀的要求，任命王缵绪代理川省主席。
不久，王缵绪被蒋介石收买过去，同康泽勾结，向蒋介石密报四川地方军人反蒋活动的材料。被激怒的川地军人联合起来揭露王的种种罪状，还调遣一部分军队集结成都，剑拔弩张，形势严峻。蒋介石又不得不罢免了王缵绪，由自己兼任四川省主席，行辕主任贺国光兼省府秘书长，代行主席职务。
武汉失守以后，国民政府各机关全部迁移霞庆，四川的重要性进一步增强。蒋介石为安定抗战大后方，千方百计分化刘湘嫡系将领，封官许愿，收买川康实力派，为张群主川铺平道路，张群也进一步拉拢川康各方人士。在组织川康经济建设委员会、川康兴业公司，开发川康的活动中，张群日渐取得了四川地方军阀的支持。蒋介石认为张群的布置已告完成，于是电转邓、潘、刘，说明自己实难再兼川省主席，拟任命张群继任，希望他们协助张群。川康实力派得到了经济实惠，认为此时再反对张群主川已不可能、遂表示赞同。
1941年11月15日，蒋介石明令发表张群为成都行辕主任兼四川省政府主席，调贺国光为宪兵司令兼重庆卫戍总司令。四川“中央化”在经过了一段艰难的历程后，终于实现。
芝麻开门的神话故事在蒋介石身上发生了，蒋介石打开的是焕发勃勃生机的天府之国。抗战八年，四川除派数十万军队出川抗战外，还向国家贡献了250多万壮丁，补充了南北战场上的国民党军队，以致当时前线有“无川不成军”之说，有60余万川军将士伤亡，另外还有几百万民工服务国防。抗战时期军粮的相当一部分靠四川提供，在1941—1945年5年的时间内共向政府交粮8200多万市石，占同期全国征粮总数的31．63％，为抗战的胜利做出了重大贡献。
事实证明，蒋介石努力实现四川“中央化”是对的，也是坚持抗战所必需的，不过他用王缵