岁月悠悠，三年的时间如白驹过隙，一闪而逝.
就在中州大陆风起云涌，人们未知的天地大劫将要之时，中州之巅函谷关外忽然迸发出一道璀璨的神光，如天地诸神降至，引得四方震动。
就在大神通者四方嗟叹，就在各方教主遥望之际，一个风轻云淡的青年在不知不觉中融入熙熙攘攘繁华依旧的大陆之中。
莫问去无尽海数年之久，中州大陆发生了翻天覆地的变化。
他归宗之时知晓，太清宗被邪魔两教偷袭，宗主华天更是重伤，逼不得已进入死关。
长老获悉，此次是邪魔两教针对正道一次有组织有预谋的行动，甚至背后有着疆外势力的影子，正道四大圣地以及中州大大小小的宗派都不约而同的遭到了袭击，而各个国家也是纷乱四起，战争不断，天朝一时间焦头烂额。
莫问等弟子被派出去查看一些普通教派的伤亡情况，帮助围剿邪魔余孽。
莫问在经过一个中州大派云兰宗的时候巧遇了故友，蛇精白素素，他们发现云兰宗整个宗门都被血洗，于是进入查探，却发现此宗的宗主徐长卿安然无恙，两人上去与其交谈却遭到了疯狂的攻击，试探之下，莫问断定此人已经入魔，在与其交手的时候莫问感觉徐长卿似乎是被某种力量所控制，而感应之下，他发现这种力量与当日和氏璧事件中遭遇的黑袍人的力量（与万恶之源同源皆源于巫）惊人的相似，见多识广的白素素告诉他这好像是巫的力量。
一旦被巫的力量控制就会变成傀儡，失去神志大开杀戒，莫问不得已将长剑送进了徐长卿的体内，结束了他的生命，但这一幕恰巧被其他赶来的正道弟子看到，莫问极力辩解，但是没有人能够相信于他，被杀的徐长卿在中州也是有着一些名气，为中州立下过汗马功劳，如今被莫问杀死，立刻引起了巨大轰动，不说众人是亲眼看到他下的杀手，单是他身边还站着一个妖族的白素素就足以让他有口难辨。在群情激愤围攻之时，白素素带着莫问离开了云兰宗。
莫问联手妖族‘血洗云兰宗’的事情不久便传开了，此时的莫问如过街的老鼠，人人喊打，身背污点，他无法回归太清宗，他把一件件事情整理到一起，感觉到自己似乎抓住了一些线索，邪魔两教的突然袭击，各国的纷乱战争，暗中似乎有什么人或势力在整个中州酝酿着一个巨大的阴谋，而他决定要彻底查清此事，来洗刷自己的清白。
于是他同白素素一起联手对整个中州进行了调查，终于，他们在调查中发现，邪魔两教的疯狂举动，以及中州诸多国家的战乱都是由人在暗中挑起的，而造成如此局面的罪魁祸首，便是莫问昔日见到的黑袍人组织，这些黑袍人都修炼巫的力量，目标直指苗疆的众神殿，只有众神殿才修炼巫术。
莫问和白素素二人不明白众神殿为什么要做出一系列手段，他们不能够知晓真相，也没有足够的证据，所以两人决定前往苗疆一探究竟。
两人来到了众神殿统治的苗疆，并成功的潜伏其中，期间莫问得到了意外的收获，他在三神塔中获得了大量‘龙元’，龙魂剑极尽升华。
随后，莫问二人在祭神坛之中发现了惊天绝密。众神殿对苗疆的恶劣环境不满已久，他们孕育出了绝世蛊王，以蛊王之力操纵了洪荒古地之中的无数妖兽，待得时机成熟，便会对中州进行大举入侵，对正道的统治造成致命的打击，先前对中州造成的骚乱就是众神殿的前期手段，用以消耗四大圣地的精力。
莫问当然不能够让这样的事情发生，他和白素素商定，回到中州之后一定要把真相散播出去。
待得莫问回到中州之时，意想不到的事情发生了，正道与邪魔两教的争斗贯穿了整个大陆的历史，但是近数千年正道大昌，邪魔选择了退避，虽然摩擦不断，但也都是小打小闹，而今在苗疆的阴谋之下，双方的摩擦却是越演越烈，原本正道也是对邪魔两教突然的歇斯底里感到疑惑，但是在邪魔两教近乎疯狂的举动之下，正道也被彻底的激怒了。大战一触激发，双方终于在连云山脉展开了决战。
这一战惨烈无比，双方弟子都损失惨重，就在双方调动神器准备巅峰对决的时候，莫问赶来了，他欲将自己得到的消息告知正邪双方，但是这时的双方都杀红了眼睛，哪有功夫听他讲解，正道认为他早已经入了魔道，脾气暴躁的林大明更是扬言将他逐出师门，莫问备受打击，一时间万念俱灰，甚至忘了此行的目的。
就在莫问恍惚之时，太清宗的撼天殿发出一阵山摇地动，撼天神剑终于在决战之时苏醒了，因为宗主华天因伤闭关，所以撼天令交给了关门弟子玉风子掌管，玉风子因为冰雪嫣，这些年一直对莫问怀恨在心，此时借着‘清理门户’的理由，对莫问痛下杀手，催动撼天令，撼天神剑以万钧之势向其压来，撼天之威不可挡，如果击中，莫问必死无疑。
就在千钧一发之际，飘渺催动魔门禁器挡在了莫问的身前，为他抵挡住了这绝世一击，但是禁器崩裂，缥缈的身影也消失无踪，形神俱灭。
莫问一时间大脑空白。