1。耿鬼其实就是皮可西的影子
当年一些玩家在玩初代的时候，发现了这两只的外形十分相似，因此有些人猜想其实耿鬼就是皮可西的影子，有趣的是，皮可西属性为普通，而耿鬼则是幽灵属性，两者的属性都无法攻击都对方，就好像皮可西打不到自己的影子，而影子也打不到他。
当然不只外形相似，打开图鉴查一下这两只神奇宝贝。
耿鬼身高1。5m体重40。5kg，皮可西身高1。3m体重40kg。
虽然耿鬼和皮可西相比之下，高了20cm，但是两者的体重却十分相近。但是，在进化为耿鬼之前的鬼斯通，身高1。6m，体重却是只有0。1kg。那麼剩下的40。4kg又是从哪里来的呢？
因此也有人猜想，耿鬼其实是鬼斯通附身于皮克西上，进而操控皮克西的结果。
2。袋龙可能就是可拉可拉死去的母亲
可拉可拉，相信玩过口袋妖怪红绿版本的人都可怜过这支小家伙。
为什么呢？借助黄版的图鉴注释：“Wears_the_skull_of_its_deceased_mother。Its_cries_echo_inside_the_skull_andcome_out_as_a_sad_melody。”“戴着他死去母亲的头骨。
从头骨中传出的叫声充满了「忧伤」的旋律。”与此同时，红绿中也有一只口袋妖怪引起了大家的注意力。因为她一出生就带有着孩子，但是却从来没有过进化/退化。那只便是袋龙。袋龙为什么一出生就会携带者一直幼仔。这个是编程者的错误还是一个紧急补救的结果？实际上没有人知道。
但是我们知道的是，两者的相似度。
如果假设说可以把可拉可拉的面具拿下来的话，那么会是什么样子呢？
很明显这两者绝对不是普通的关系。
尤其是在参考了口袋妖怪青/赤之救援队的对话之后。当袋龙的血量降到5%以下的时候：“I‘m_done。。。Please，take_care_of_my_baby。。。”
“我不行了……请，照顾好我的孩子……”
当可拉可拉的加入的时候：“I_feel_lonesome，but_I‘ll_work_hard_for_my_mother‘s_sake!”“我觉得很孤单，但是我会为了我的妈妈而奋斗的！”
故事逐渐明了。在幽灵塔中出现的可拉可拉，实际上便是火箭队进入之前所存在的袋龙。袋龙为了保护自己的孩子而死，剩下的可拉可拉便带起母亲的头骨作为面具，在塔中游荡。
但这仅仅出现在初代的废案当中，因为如果每一只可拉可拉都是这样那岂不是太苦逼了么。
有人相信，袋龙袋子里住的小袋龙，最后会进化成袋龙，但若袋龙妈妈死去的话，小袋龙就会戴上袋龙母亲的头颅来保护自己。
但这还是很矛盾。是嘎拉嘎拉出现了所以真相就是：幽灵塔在初代的时候是被火箭队所占据的。从村民的口中可以得知可拉可拉戴着的头骨在市场上相当的贵重。火箭队驻扎在幽灵塔里面的目的便是抢夺可拉可拉戴着的头骨。
而且据村民们的叙述在这个过程中有一只嘎啦嘎啦被杀死了。而那只母亲的灵魂便守在了塔的第六层的门口。
把火箭队永远的堵在了第七层（知道赤爷了……）。在赤爷击败她之后。母亲的灵魂意识到了这个人可以帮助自己满足心愿，击败塔中的火箭队。于是一颗再无牵挂的灵魂便安息了……。
3。森林洋馆下毒事件
不时出现的老人和少女，藏在电视的洛托姆，盯著主人公的肖像和只有在这个房间出现的耿鬼，藏在厨房垃圾箱的解毒剂，掉在洋馆里的羊羹，楼梯前消失的另一座铜像，一切说明了在这里以前发生过什麼。
现在，从多种假说抽出一个稍加修改，献给大家。这是20年前的事情。。。。。。。。
在一栋洋馆里，住著一位老人，双胞胎孙子和孙女和两只神奇宝贝，他们的生活非常幸福，直到他们家来了一位青年。。。。。。
他是一位企业家，是老人的弟子。为了受到老师的教导，他决定住上几年。双胞胎马上就喜欢上了他，再加上他很会画画，双胞胎也开始向他学习。不过，没过几个月，那个青年向女孩下了手，对正处於儿童期的女孩下了手。。。。。。。。
他决定杀掉少女之外的的人，得到一切。实际上，他只是想得到少女珍贵的神奇宝贝和金库的密码。生活并没有因青年的暴举扰乱，但男孩知到，自己的双胞胎姐姐被青年饱受屈辱，但自己什么都没有做到。。。。。。。
一天晚上，在电闪雷鸣的暴雨天，青年终於下了手，他在男孩和老人的饭菜中下了毒。但这一幕不幸被女孩看见了，女孩很快就明白，他要杀掉自己以外所有的人。
将饭菜搬到食堂的工作向来由女孩担任，女孩将饭