乱，有十几个匪徒趁乱杀入城内，靠近官署，看到潘延年处还亮着灯便向这里摸了过来。看到潘延年一幅文弱书生和官吏的样子，便不是很在乎，顺便叫两个匪徒进去想活捉他当人质好拿赎金。
当两个匪徒拎着明晃晃的刀子走进去时，在一旁服侍的书童当时就吓软在地上，潘延年却若无其事，依然伏在桌子上看清单，仲荆两个匪徒靠近来，直接从怀里掏出一把短镜抵着一个匪徒凹删袋就是一枪。
看到同伴的脑袋就像一个被砸开的南瓜，红的白的全溅到自己的脸上，剩下的那个匪徒一时都吓傻了，看到潘延年又从桌子的抽屉里摸出一把短锐来，当时就吓得将刀子一扔，跪在地上求饶。
潘延年一声不哼。只管举起短镝对着那个匪徒的脑袋就是一枪，谁知扳机一扣，击铁出脆响，短镜却没有开火。匪徒被吓得魂飞魄丧，只是在那里鼻涕眼泪的只继头。潘延年皱着眉头扳开击铁，对着匪徒脑袋又是一枪。还是没有响，原来引药受潮了。
潘延年不耐烦了。给起地上的刀子，对着匪徒就是一顿乱砍，谁知他是个文人，砍人这个活不熟悉，几刀下去，匪徒被砍得血肉模糊，惨呼连连，但是却受利不重。
待到守军护卫送进来。匪徒被砍成了血葫芦，身上还满是被吓出来的屎尿。潘延年挥挥手让护卫将尸体和伤者抬出去！回过身去继续看。
虽然这件事一直被当成传说，但是潘延年在马六甲还是杀了不少人，为了抑制土著和海盗对马六甲的骚扰，潘延年下令将所有俘虏的土著匪徒和海盗全部处死。挂在马六甲港口外面，一时间马六甲港外岸挂满干尸成为传遍南海西洋的奇观。
后来随着明军北伐大胜，海军主力开始南调，重点经营南海地区，一时间马六甲的力量得到了极大的增强，以前的困境开姑姑转。随着大明海军组建第四舰队进驻马六甲，马六甲的实力到达了顶峰，麻喏巴歇国水师被打得七零八落，各色海盗在马六甲海峡再也看不到踪迹，当地土著匪帮也是躲得远远的，潘延年便全力投入到马六甲的建设中。
随着《大明航海条例》的公布，马六甲成为大明最大的中转港和自由港。
虽然进出的商船每日以百数计，但是因为是自由港的缘故，马六甲无法收税，只能对货品进行初检，给通关文书，做为国内海关验关的凭证之一，只有当货物转运至遢罗、真腊、占城、麻喏巴歇国等地时才收取关税，而且马六甲关税属于国税地方一个子都别想捞着，每月一次由第四舰队的战舰押解回南京。所以马六甲看着繁华富庶，实际上就只是个表面上看着鲜光而已。
潘延年不等不靠。开动脑筋广开地方税源。马六甲除了是自由港，还是最大的中转港。船多海员多，尤其是在《大明航海条例》颁布之后，大食、阿比西尼亚、印度等国的商船到达马六甲将货物转至大明商船后就必须等在马六甲，直到雇主或者船主用大明商船将大明货品运到马六甲再装船回航。这一等就是个。把月，遇上台风期或者逆风期，这等的时间就指不定了，短则两三个月，长则半年都有可能，还有大明海军将士和商船海员。常年保持在上万人，潘延年就把主意打到了这方面。
潘延年从内阁计部申请了一笔补助，否向当时还执行商业银行职能的大明皇家银行贷得一笔款项，开始在马六甲大兴土木。
马六甲港口由大明内阁直接投资修建，潘延年不必去担心，只需要协助管理就行了，他将重点放在了马六甲城的建设上。
先潘延年请南京格物院营造研究所根据马六甲地理环境做了一份城市规划准备将马六甲城打造成花园城市。潘延年先进行三通一平。即水通。路通，排污通和场地平，然后在几条干道上修建建筑物，而且是功能分区进行修建，如这一区是饮食区，就全部只准修建与酒楼有关的建筑，那一区是旅馆区，则全是旅馆。
看到马六甲城的基础建设已经建设开来，国内一些商家意识到马六甲的地理位置，纷纷跑来抢占商机先手。潘延年将马六甲城的土地按照规戈进行拍卖，获得了一笔资金，不仅偿还了贷款，手头还有富余。
潘延年为了节省成本。妥守军到城外各地强征土著青壮为劳力，继续大兴土木。经过数年的展，到明历六年。马六甲城已经成为一座方圆二十里。拥有五万常居人口的城镇。而且这座城镇道路两边绿树成荫，处处可见花园草地。潘延年仿唐东都洛阳制，挖出四道水渠，引入马六甲河水，贯穿全城，正所谓小桥阁楼，渠通岸荫。在马六甲城，可以吃到大明各地的美食外，还可以品尝正宗的大食、阿比西尼亚、印度、遢罗等国的美食，更有大食、印度、遏罗、真腊等国的美女在此汇聚，成为海员们心目中的天堂，以前盼着大明商船快点的诸国海员们现在只盼着晚点来，好让自己在马六甲待得更久一些。
除此之外，潘延年更为马六甲港建设做出了巨大贡献，他深知，马六甲港是马六甲城的基础，马六甲港越繁忙，马六甲城就越繁荣。因此他在建设马六甲城之余，动员大量的当地劳力，扩宽港区，修建新码头和防波提，不仅使的马六甲