由于原始社会阶段，没有文字记载，所以自春秋战国以来以致如今，中国的历史典籍，都只是根据历史传说追溯到五千年前的新石器时代、父系氏族公社阶段的黄帝时期。然而，在黄帝时，中华民族就有三个著名的伟大始祖，即黄帝、炎帝、蚩尤。但是，在我国历来的官方正统史中，一直把黄帝作为中华民族的始祖，始君，后来炎帝也逐渐被确认。所以，这里我们着重谈谈蚩尤是中华民族的伟大始祖之一的问题。
首先，应当指出，蚩尤是中国苗族的先祖。因为如今的中国苗族的族属渊源，和远古时代的“九黎”、“三苗”、“南蛮”有着密切的一脉相承的关系。在原始社会末期，在我国长江中下游和黄河下游一带，远古的时候就生活着很多原始人类；他们经过世世代代的生息繁衍，通过艰苦的劳动，在距今五千多年前，逐渐形成了部落联盟。
这个部落联盟叫做“九黎”，以蚩尤为乎领。《国语·梦语》注中说：“九黎，蚩尤之徒也”。《书吕刑释文》、《吕氏春秋·荡兵》、《战国策·秦》高诱注，都说蚩尤是九黎之君。他们借助优越的地理条件，不断地辛勤开拓，使生产力不断提高，社会经济不断发展，一跃而成为雄踞东方的强大部落，并且最早进入中原。我党著名历史学家范文澜同志写道：传说中的中国远古居民，“居住在南方的人统被称为‘蛮族’。其中九黎族最早进入中部地区。九黎当是九个部落的联盟，每个部落又包含九个兄弟氏族，共八十一个兄弟氏族。蚩尤是九黎族的首领，兄弟八十一人，即八十一个氏族酋长……是以猛兽为图腾，勇悍善斗的强大部落。”[2]在九黎部落进入中原之后，炎帝族也自西方牧进入中部地区，与九黎族发生长期的部落间的冲突。九黎族驱逐炎帝族，直至涿鹿。后业，炎帝族联合黄帝族与九黎族在涿鹿展开了原始社会末期规模空前的部落大战——涿鹿大战。在战争初期，黄帝由于兵力不足，又对地形气候不了解和不习惯，因而“黄帝与蚩尤九战九不胜”[3]；后来黄帝族创制了指南车以识别方向；[4]并大大增添实力，[5]才转败为胜。最后双方决战于涿鹿，九黎被打败，其首领蚩尤也被擒杀。
九黎战败以后，其势大衰，但他们还据有黄河下游和长江中下游一带的广阔地区。到尧、舜、禹时期，他们又形成了新的部落联盟。这就是史书上说的“三苗”，又称为“有苗”或“苗民”，三苗这种部落群体的发展，最后形成了部落酋长国。范文澜写道：“苗族被禹战败后，退出黄河流域，据战国时人（吴起）说，三苗国的地点大致在长江流域内一块狭窄的地方，这种说法是否可信无从考证，因为战国时代离三苗时代已经过去近2000年，而且吴起之前，大多把三苗作为中原地区民族。从古籍（尚书）的记载来看，三苗作为一个民族或者国家在尧舜禹时期遭到了彻底的毁灭，其遗部被迁往西北。
三苗与后来荆蛮是否有关系，已经无从考证，它们的地点并不对应，虽然都在长江流域，但荆蛮的地点大致在长江上游的汉水流域，而三苗的地点，无严格考证，如果根据吴起的话，大致在长江中下游的湖南、江西两省交界的洞庭湖和鄱阳湖之间的狭窄区域，在时间上更不对应，相隔了一千多年。
三苗与后来的苗族，更不存在对应关系，“苗族”这个称呼是宋代才有的，与三苗时代隔了三千多年，而且苗并非苗族的自称，是宋人对南方少数民族的通称。
从考古来看，如果三苗确实存在，应该与屈家岭、石家河文化有关，但这两种文化都具有强烈的藏缅民族特色，以虎为图腾，而苗族文化无法找到与之有明确对应关系的证明。
可见三苗、荆蛮、苗族，并不存在任何对应关系，它们是不同时代三个不同族群。
但是九黎和三苗还是有一定关系，《周书·吕刑》的“蚩尤对苗民制以刑”，《国语·郑注》的“有苗复九黎之德”，三苗，九黎之后也”，等记载，就已经显出“九黎”和“三苗”的亲缘关系。《礼记·衣疏·引甫刑·郑注》说，“有苗、九黎之后……居于西裔者三苗”等语，也直接指出“三苗”是九黎的后裔。宋代以后，一些人将苗族和三苗联系起来，例如：“苗人，古三苗之裔也”[7]；“苗者，三苗之裔”[8]；“考红苗蟠据楚、蜀、黔三省之界，即古三苗遗种也”[9]。但是这些书大都是一些游记、县志之类，不具权威。不过现在的苗族人民普遍地将蚩尤和三苗视为自己的先祖。
五千年前，与黄帝同时代的九黎部落联盟，据史书记载，其成员中除了苗族以外，还有黎族、瑶族、畲族等少数民族。如果按照过去史书的称谓，把远古时代居住在南方的人统称为“蛮族”，或称“南蛮”、“荆蛮”，那么就把我国在南方许多少数民族都包括在内了。这就是说九黎、三苗、南蛮，不仅是苗族的先民，而且也是黎族、瑶族、畲族和南方其他一些少数民族的先民。而蚩尤是九黎之君，所以，蚩尤也就不仅是苗族的先祖，同时也是黎族、瑶族、畲族和其他一些少数民族的先民。同时我们还应当看到，苗族在古代多次迁徙过程中，包括南迁和西迁的过