选派僧人诵经七日，然后由驻藏大臣主持，在大昭寺释迦牟尼像前抽签认定。并在拉萨和北京雍和宫各设一金瓶，分别用于西藏和蒙古的高级活佛的转世认定。掣签之后，要上报清朝中央，请求批准。乾隆在其《喇嘛说》中说之所以实行金瓶掣签制，是为了杜绝活佛转世中的舞弊行为，即许多活佛往往转生于某一家族，并认为护法神降言认定的方式不可取，实行金瓶掣签制可革除弊端。为了防止蒙古贵族与神权相结合，乾隆时期规定执政的蒙古札萨克王公贵族之子，不准选为蒙古活佛的转世灵童。”蒙古番子部落呈报呼图克图大喇嘛之呼弼勒罕（蒙语指转世灵童——引者），准于闲散台吉或属下人等及唐古忒平人（指藏族平民——引者）之子嗣内指认。其达赖喇嘛、班禅额尔德尼之亲族及各蒙古汗王、贝勒、贝子、公、札萨克、台吉等子孙内均禁止指认呼弼勒罕。”⑨清朝对活佛转世制方面的一系列整顿改革，旨在强化对藏传佛教事务的管理，稳定蒙藏边疆地区。
清代在西藏，金瓶掣签主要用于达赖、班禅及前后藏等地的各大呼图克图。第八世达赖喇嘛去世后，其转世灵童出自于康区，西藏地方认定转世灵童就此一人，遂上报朝廷，请求免除金瓶掣签，得到嘉庆皇帝的允许。选定第十世、第十一世、第十二世达赖喇嘛时，都实行了金瓶掣签。认定第十三世、第十四世达赖喇嘛时，没有实行金瓶掣签。历辈班禅中，在认定九世班禅、十一世班禅时实行了金瓶掣签。
确定转世灵童后，就要举行迎请和坐床仪式。将转世灵童从其俗家迎到寺中，信众热烈欢迎，法号声声，异常热闹。坐床及登座仪式，表明正式继任活佛地位。此处以十三世达赖喇嘛的坐床仪式为例，略加了解活佛坐床仪式。十三世达赖喇嘛的坐床仪式定在1879年农历六月十三日，六月十日摄政王从布达拉宫前往灵童所在的寺院迎请_0之后的活动，依《十三世达赖喇嘛年谱》摘要如下：”十二日驻藏大臣松淮和迎接人员汇集在岗对堆古滩宿营地迎候，达赖灵童乘坐黄轿与摄政王和经师普觉等由欢迎仪仗队中间走进宿营地，与驻藏大臣见面并互换哈达，然后坐于大帐篷内的宝座上，依次接受摄政王、班禅大师的代表、经师普觉、第穆呼图克图、公爵、噶伦和四品以上官员，甘丹寺东北二法主、三大寺和上下密院的住持、各级僧俗官员、各林、各位小活佛、木如寺、喜德寺、私房主、回族、尼泊尔人、举佛幡的人和各界各阶层人士敬献的哈达，并举行庆祝活动。十三日，达赖灵童正式进入拉萨布达拉宫，当天所经各街道，均打扫得干干净净，路两旁排放着石块，洒画着白色石灰线条，布达拉宫和大昭寺屋顶上插挂了伞、幢、彩旗，并伴有乐队奏乐吹号，街道两旁的群众焚香致敬，敲锣打鼓。达赖灵童乘坐黄轿，在引香和仪仗队的引导下，同驻藏大臣、摄政王等欢迎人员一起到大昭寺朝拜释迦牟尼佛像，并面对佛像坐于宝座上诵经祈祷。然后乘坐大轿抵达布达拉宫，叩拜皇帝画像和观音佛像（为布达拉宫的主供——引者），献哈达。接着进日光殿，升宝座，摄政王向达赖灵童稽首敬献曼札、三佛田，噶厦政府敬献了供品。”⑩十四日，灵童坐于布达拉宫色西彭措大殿上，接受皇帝赏赐的物品，并宣读圣旨，接受各位政要、宗教上层敬献的哈达和礼品。之后，观看藏戏，举行庆祝活动。无论活佛地位高低，均要举行坐床仪式，举行完此仪式后，其转世身份才完全确定。
三、活佛的培养和地位
追溯活佛最早的前世，大都被宣称为佛菩萨的化身。通过母胎降生世间的灵童虽说灵异，但仍需要后天的学习培养。