1924年陆洪涛升任甘肃督军后，将省直属部队编为甘肃陆军第一师，自兼师长，下辖两个旅，李长清为第一旅旅长，下辖包玉祥、姚廷相两团。
1925年3月，陆洪涛中风卧床，李长清便暗中与陇东镇守使张兆钾联系，欲拥张来省任督军，而由自己接任陇东镇守使。李长清率兵入省督军府，逼陆洪涛委任其为师长，逼陆交出师长印信，随后突袭第二旅黄得贵部，将其击溃，形成独霸兰州的局面。
1925年7月，陆洪涛在李长清等威迫之下，以自己的风疾不治，特电北洋政府临时执政段琪瑞，辞退督军兼省长职。北洋政府发表冯玉祥为督军，冯玉祥令第二师师长刘郁芬前赴甘肃，代行督军职务。
李长清率兵在打败黄得贵后，自任第一师师长，于兰州东郊一带，仍行积极布防，防备发生其他事变。
这刚赶上战争结束，严谨部署的期间，自己管辖之地出现这类事件，李长清为平息谣言，特遣一个班来巡查。
当时的编制还不算太正规，虽说一个班，但人数快赶上一个排了。